İlk oyunda olduğu gibi yine bu oyunda da Gordon Freeman isimli bilim adamının maceraları anlatılmaktadır. Oyunun büyük bir bölümü Doğu Avrupa'da yer alan kurgusal Şehir-17 ve çevresinde geçmektedir.

Kurgu, ilk oyundan yaklaşık 10 sene sonrasını konu almaktadır. Bu 10 sene içerisinde işgalci uzaylı güç olan Combine, ilk oyunda gelişen olaylar sonucunda dünyayı 7 saat savaşı ile 7 saate ele geçirmiş ve insanları köleleştirmiştir. Bunun sonucunda bizi zamanda hapseden G-man bir tren ile Şehir-17'ye gönderir, ve macera burda başlar...

FPS seven herkesin mutlaka oynaması gereken bir oyun.